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site:offres:2020:stages:dna_systems
Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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site:offres:2020:stages:dna_systems [02/12/2019 11:15] amann créée |
site:offres:2020:stages:dna_systems [02/12/2019 11:17] (Version actuelle) amann |
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| Ligne 1: | Ligne 1: | ||
| - | Proposition de stage de Master 2 | ||
| - | === Algorithmes d’encodage de données binaires en séquences ADN === | + | |
| + | |||
| + | ===== Algorithmes d’encodage de données binaires en séquences ADN ===== | ||
| + | |||
| + | === Proposition de stage de Master 2 === | ||
| * Equipe d’accueil : Base de Données, LIP6 | * Equipe d’accueil : Base de Données, LIP6 | ||
| Ligne 35: | Ligne 38: | ||
| 1=T=G) et permet de moduler des séquences afin qu’elles satisfassent des contraintes spécifiques comme par | 1=T=G) et permet de moduler des séquences afin qu’elles satisfassent des contraintes spécifiques comme par | ||
| exemple : | exemple : | ||
| - | - Taux de présence de nucléotides spécifiques, par exemple %GC du génome de l’organisme hôte, pour | + | - Taux de présence de nucléotides spécifiques, par exemple %GC du génome de l’organisme hôte, pour améliorer les performances en lecture et écriture ; |
| - | améliorer les performances en lecture et écriture ; | + | - Interdiction des répétitions de plus de trois nucléotides (ACGT) identiques pour réduire notamment les erreurs de lecture et d’écriture ; |
| - | - Interdiction des répétitions de plus de trois nucléotides (ACGT) identiques pour réduire notamment les erreurs | + | - Suppression et ajouts de séquences spécifiques pour obtenir un assemblage de fragments biocompatible pour l’organisme vivant ; |
| - | de lecture et d’écriture ; | + | |
| - | - Suppression et ajouts de séquences spécifiques pour obtenir un assemblage de fragments biocompatible | + | |
| - | pour l’organisme vivant ; | + | |
| == Travail à effectuer == | == Travail à effectuer == | ||
| Ligne 52: | Ligne 52: | ||
| == Compétences souhaitées == | == Compétences souhaitées == | ||
| - | * Bonnes compétences en algorithmique (recherche stochastique, algorithmes génétiques) et | + | * Bonnes compétences en algorithmique (recherche stochastique, algorithmes génétiques) et programmation (Java, Python) |
| - | programmation (Java, Python) | + | |
| * Des connaissances en biologie/génétique sont bienvenues | * Des connaissances en biologie/génétique sont bienvenues | ||
site/offres/2020/stages/dna_systems.1575281738.txt.gz · Dernière modification: 02/12/2019 11:15 par amann
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